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July 5, 2018

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coolia spp의 다양성. 그레이트 배리어 리프 (gbr)의 중앙 지역에서 발병 CFP가 있는 지역은 출판 된 기록이 없으므로 알 수 없습니다. 이 연구에서 우리는 coolia spp의 다양성에 대 한 첫 번째 보고서를 제공 합니다. 중앙 gbr 있음. coolia 종의 긴장은 형태학 상과 계통 발생 분석의 조합을 사용 하 여 설치 된 문화 및 그들의 분류학 위치에서, 고립 되 고,가지고 갔다. rrna 페론 (18s와 28s 유전자 및 그것의 지구)의 지구는 계통 발생 분석을 위해 사용 되었다. 우리는 중앙 gbr 세 알려진 종 (c. malayensis, c. alenalis와 c. canariensis)를 포함 한 coolia 종의 높은 다양성을 항구 뿐만 아니라 형태학 적으로 매우 유사 합니다 암호화 된 수 종 발견 c. monotis 및 c.

malayensis 하지만 계통 발생 아주 명료한. 두 번째 암호 종 가까이 c. canariensis에도 존재할 수 있습니다. 높은 분자 다양성의 coolia spp. 중앙 gbr에서 기술 되 고이 tadon 내의 taxomic 혼란에 의해 생성 된 문제는 토론 된다. coolia 종의 5 개의 문화에서 세포. (표 5) 원심 분리 (2300 rcf 5 분에 대 한 peleted 했다에 eppendorf 5415d 원심 분리기, 노스 라 이드, 뉴 사우스 웨일즈 2113, 호주) 같은 원심 분리 뒤에 TE 버퍼 (10 mm 트리-HCl, 1 mm edta, pH 8)에서 3 회 세척 1.5 ml eppendorf 튜브에 전송 하기 전에 프로토콜을 포함 하는 500 µ l 10% chelx ® 100 [43] 및 5 µ l의 20 mg ml-1 단백질 가수분해 효소 K. 튜브는 55 ° c에서 2 시간 동안 회전 오븐에 배양 하 여 20 분간 94 ° c에서 배양 한 다음 9200 rcf에서 원심 분리 하였다 ( eppendorf 5415d) 5 분 및 뜨는에 대 한 새로운 eppendorf 튜브로 전송 및 저장-20 ° c. 거의 완전 한 18s rrna 유전자의 PCR 그리고 연속, 모든 또는 몇몇의 D1-D6 지구 및 가득 차 있는 그것의 지구를 포위 하는 28s rrna 유전자의 파편 (마지막을 위해 NQAIF103만) 사용 된 뇌관과 어 닐 링 온도 표 2에서 목록으로 만들고. PCR 반응은 다음과 같이 설치 되었다: 템플렛 DNA의 1 μ l, 800 µ m 각 dntps, 5 pmol 각 뇌관, 2.5-3.5 mM MgCl2, 1x Kapa2G PCR 완충기 B와 Kapa2GFast의 1 개 단위 (gendsworks Pty 주식 회사, 힌마쉬, 남 호주, 호주) 20 µ l .의 총 양에 서 반응은 세를 겪었다 94 ° c에서 ee 분 초기 변성, 그리고 35는 94 ° c에서 30 분의 변성 사이클, 15 s (어 닐 링 온도에 대 한 표 2 참조), 72 ° c에서 60 s 확장, 그리고 72 ° c에서 3 분의 최종 확장 단계. PCR 제품은 1.5% agarose 젤에 구상 되었다, 그리고에 의해 청소 하는 isopanol 강 수가. 시퀀싱 반응은 호주 게놈 연구 시설 (퀸즐랜드 대학)에서 큰 염료 터미네이터 사이클 키트 v 3.5을 (응용 biosystems, mulgrave, 빅토리아 호주)를 사용 하 여 수행 했다.

모 세관 분리는 AB 3730xl 플랫폼에서 수행 되었다. 중앙 gbr 지역 coolia spp의 이전에 보고 높은 다양성을 항만., 잠재적으로 독 소를 생산 하는 알려진 두 종족을 포함. 알려지지 않은 독성의 이상한 종의 존재는 dinoflagellates 안에서 암호화 된 다양성의 중요성을 강조 한다. 표 1입니다. coolia spp의 clades 사이에 수정 되지 않은 p-거리 (± 동남). 몇몇 기능은 coolia의 다른 종의이 긴장의 형태학 차별을 허용 한다. 첫째, 단지 20 µm의 평균 길이와 19 µm 평균 너비와,이 호주의 변형은 지금까지 설명 되어 종족의 보다 작은 세포를가지고 있습니다.